Cell | 建立人类树突状细胞与辅助性T细胞粒子模型

细胞内-细胞内交互作用诱发复杂，限于大量水分子与回波渠道，学界钻研多年，仍旧是管中会窥豹。来自法国巴黎PSL深入研究大学的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的评论，成立了试验中与理论相结合的深入研究原理，试验中上，在核糖体水平样品了细胞内所排泄的特异性与应激反应；意味着，成立了回波输入转换成互不间的成立联系和交互作用关系。著者以人类树突状细胞内（Dendritic cell，全名DC）与这两项T细胞内（T Helper cell，全名Th）互不间的交互作用为深入研究对象，量化了36例DC涉及的回波水分子和17种Th排泄的特异性，并依靠这些样本成立数学假设，演算出56种已经被试验中猜测的细胞内具体来说，与此同时，还推测出290种可能关系，并猜测了IL-12p70可以通过IL-1回波渠道抑止17型这两项T细胞内（全名Th17）。首先，著者搜集了人类白细胞内举例来说的DC（MoDCs）和外周血液CD11c+DC（bDCs）两类细胞内，并焦虑24小时。所选用的焦虑回波主要包含三大类共计14种。第一种：内源回波水分子，以外干扰素beta（interferon β，全名IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll由此可知酶的配基，以外Toll4酶的GABA脂多糖（ lipopolysaccharide，全名LPS），Toll1/2酶GABAPAM3CSK4，Dectin1GABACurdlan，Toll2/Dectin1GABA zymosan，Toll7/8酶GABAR848，Toll3酶GABA poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，以外冷却灭活的Candida albicans （全名HKCA），李斯特菌（Listeria monocytogenes，全名HKLM），Staphylococcus aureus （全名HKSA）， Streptococcus pneumoniae （全名HKSP）和亚型（influenza virus，全名flu）。接下来，著者通过流式细胞内妖术等原理，样品了36种DC涉及水分子的强调可能，其中会，29种保持稳定细胞内颗粒，7种保持稳定细胞内排泄上清之中会。结果显示，除了一些已知的DC细胞内鼓动都有，著者还有了一些新的挖掘出：（1）zymosan焦虑的MoDCs 强调专业性的CD54 和PVR；（2）亚型焦虑的MoDCs可以抑止ICOSL；（3）LPS焦虑的MoDCs 可以抑止专业性的CD30L和CD83。再下来，著者将这些焦虑过的DC与T细胞内共培养6天，随后样品Th的抑制效率以及17种Th涉及特异性的强调排泄可能。有趣的是，著者将Th和DC的表现互不比较，挖掘出，这二者互不间并不存在同构的关系，也就是说，两种焦虑物对DC产生的缺点类似，但是，这两种焦虑物所处理的DC与T细胞内共培养之后，产生的缺点很可以大相径庭。接着，著者选用核糖体组学的原理，以上述试验中样本成立假设。简单来说，著者综合DC转换成的36种回波水分子和Th转换成的17种效应水分子，将两两互不间的关系一般化为“反之亦然转录”和“某种程度转录”两种，并且，还加入样本库和已发表手抄本中会的信息，成立了复杂的回波转录因特网。例如，通过这一假设，著者挖掘出， IL-10的某种程度转录水分子以外OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而反之亦然转录水分子以外Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这由此可知，给予DC各不相同的焦虑回波，著者就可以推断出Th鼓动细胞内IL-10的强调排泄可能。之后，著者能用这由此可知假设，想要推测并猜测新的细胞内具体来说。通过成立的假设，著者挖掘出，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2携手排泄时，极端于转录IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 携手出现时，则更极端于转录IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的强调水平都显着降低。这些结果说明，IL-12作准备Th17的抑止分化。为了进一步探讨IL-12抑止Th17的有助于，著者选用体外抑止Th的假设，挖掘出，IL-12并不能如此一来抑止Th17，但是，同时加入IL-1和IL-12，Th17就抑止出来了。这是一篇试验中与理论相结合的经典作品。试验中结果与计算建模互不支持，互不指导，相辅相成。如下图所示，试验中之外选用了密切携手点两之外样本，一是何种焦虑下DC细胞内的鼓动，二是鼓动后的DC对T细胞内的作用。理论之外以DC和T细胞内的转换成特异性为核心，成立了特异性互不间的反之亦然和某种程度转录因特网假设。通过这一假设，著者预测出一些新的细胞内间具体来说，最终再用试验中猜测这些关系是否属实。这篇评论的亮点有三处，一是成立和试验中理论相结合深入研究的蓝本，二是评论中会提供的诸多细胞内转录信息以供深入研究参见。原始注解：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.